Notesnook 3.4.12 把端到端加密做成默认选项：笔记在离开设备前就已加密，密钥只在用户手上；代码与同步服务器全部开源，免费版不限笔记数量与登录设备。

思源笔记把内容拆成可独立引用的块，配上双向链接、数据库和 FSRS 闪卡，数据默认存在本地硬盘。3.8.9 版改进了文档标题命名、脑图与数据库自动化，适合做长期知识库。

MuPDF 1.28.5 是 AGPL 开源的文档引擎，PDF、XPS、EPUB 与漫画包都能读，自带 mupdf-gl 查看器，十九个命令行工具管渲染、转换与签名。

Logseq 是一款以块为基本单位的开源知识库工具，同一行文字既是大纲里的一个节点，也能被其它页面引用；官方另配每日笔记、卡片复习与查询汇总三条路径，桌面与移动端都有版本。

Anytype 是一款本地优先的知识管理工具：数据存在自己设备上，同步走点对点网络并全程加密，对象模型可以承载笔记、任务与数据库，个人使用免费，把数据的主动权交还给你。

Todo.txt：用纯文本文件管理待办事项的开源格式与工具集，命令行、桌面、移动端社区应用齐全，数据永远属于自己。

Joplin 是一款开源免费的笔记与待办应用，支持 Markdown 编辑、端到端加密(E2EE)和多设备同步。笔记以开放格式保存在本地，支持 Web Clipper 浏览器扩展剪藏网页内容，通过插件系统和自定义主题扩展功能，全平台覆盖 Windows/macOS/Linux/Android/iOS。